Los ejes que contienen y contextualizan la política son la Cultura pro innovación e Institucionalidad. Mientras el primero crea un entorno favorable e instala habilidades en actores clave, el segundo busca mejorar la coordinación, foco, eficacia y eficiencia del sistema.

Los ejes que marcan el énfasis de la política son dos: Regiones, cuya prioridad es fortalecer las capacidades para la innovación, y Clusters, que determina los sectores productivos prioritarios, por sus ventajas comparativas y alto potencial global.

Finalmente, los ejes que contienen los motores de acción del proceso de innovación son el Capital Humano, las capacidades I+D y las plataformas transversales, y el Emprendimiento Innovador y transferencia tecnológica.
Estas líneas se relacionan entre sí, interactuando como un sistema dinámico y complejo.